支付宝备用金逾期后只能手动还款，系统不会再自动扣款，用户需确保支付宝账户（包括绑定银行卡）有足够的还款金额，因为备用金不支持部分还款。

另外，支付宝备用金逾期后用户的借呗权限也会被暂停。

支付宝备用金逾期会影响个人芝麻分，所以备用金到期一定要及时还清，方便以后继续使用。