有商业贷款可以公积金贷款，商业贷款与公积金贷款互不影响。

个人住房组合贷款是指，符合个人住房商业性贷款条件的借款人又同时缴存住房公积金的，在办理个人住房商业贷款的同时还可以申请个人住房公积金贷款，及借款人以所购本市城镇自住住房(或其他银行认可的担保方式)作为抵押可同时向银行申请个人住房公积金贷款和个人住房商业性贷款。

若用户在没有还清商业贷款的情况下，再申请的住房公积金贷款首付要按照第二套房计算，首付比例最低50%，利率会上浮10%。